Le TARDIS, avec à son bord le Docteur, Donna et Martha, échoue dans un tunnel sur une planète inhospitalière, en l'an 6012. Là, ils sont immédiatement pris entre les feux d’une guerre qui dure depuis « des générations » et oppose des humains à des extraterrestres humanoïdes, sortes de poissons évolués, les Haths. Les humains, qui se reproduisent par clonage express, créent en quelques minutes un clone féminin du Docteur, Jenny, qui est elle aussi un Seigneur du Temps. Le Docteur veut faire cesser la guerre entre les humains et les Haths mais les deux clans ont pour but de vaincre l'ennemi avec la "source" car ils croient que c'est une arme.