Avec l'aide du Lieutenant de Police Jim Gordon et du Procureur Harvey Dent, Batman entreprend de démanteler définitivement les organisations criminelles de Gotham. L'association s'avère efficace, mais le trio se heurte bientôt à un nouveau génie du crime, plus connu sous le nom du Joker, qui va plonger Gotham dans l'anarchie et pousser Batman à la limite entre héros et assassin.